对于二套房首次使用公积金贷款的话，如果如人均面积高于平均水平的，按第二套首付3成，五年期以下(含五年)的公积金贷款利率为3.33%,五年期以上的公积金贷款利率为3.87%。即便利率水平略高于基准利率，但相对于商业贷款来说，还是低了很多，也可以节省不少的利息。
住房城乡建设部、财政部、人民银行、银监会11月3日联合印发《关于规范住房公积金个人住房贷款政策有关问题的通知》指出，第二套住房公积金个人住房贷款首付款比例不得低于50％。严禁使用住房公积金个人住房贷款进行投机性购房。
通知指出，第二套住房公积金个人住房贷款的发放对象，仅限于现有人均住房建筑面积低于当地平均水平的缴存职工家庭，且贷款用途仅限于购买改善居住条件的普通自住房。
通知明确，为支持缴存职工购买首套普通自住房享受低首付、低利率贷款政策的需求，使用住房公积金个人住房贷款购买首套普通自住房，套型建筑面积在90平方米（含）以下的，贷款首付款比例不得低于20％；套型建筑面积在90平方米以上的，贷款首付款比例不得低于30％。
